Micron Document
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FASTA-Algorithmus
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Der heuristische FASTA-Algorithmus wurde 1985 von David J. Lipman und William R. Pearson als FASTP für Proteine entwickelt.cite-ref-1[1] Das Programm wurde 1988 auf Nukleotide erweitert.cite-ref-2[2]

FASTA sucht nach Ähnlichkeiten zwischen Sequenzen oder vergleicht eine gegebene Sequenz mit einer Sequenz-Datenbank. Die Speicherung der Sequenzdaten erfolgt im FASTA-Format.

Eine Anwendung findet der Algorithmus beispielsweise beim SIMAP-Projekt.

Contents

• Siehe auch
• Literatur
• Weblinks

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Siehe auch

• Sequenzalignment
• BLAST-Algorithmus

Literatur

cite-note-11. ↑ Lipman, D.J. & Pearson, W.R. (1985): Rapid and sensitive protein similarity searches. In: Science. Bd. 227, S. 1435–1441. PMID 2983426
cite-note-22. ↑ Pearson, W.R. & Lipman, D.J. (1988): Improved tools for biological sequence comparison. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. Bd. 85, S. 2444–2448. PMID 3162770 PDF

Weblinks

• EBI: Online Interface

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